南屯教會是1961年4月由門諾會宣教士高甘霖及長老會牧師呂春長所共同開拓。1963年成立教會，1965年購得現址，1965年10月建，1966年獻堂。
創設日期：1961年 4月 1日
創設者：高甘霖牧師
開拓者：呂春長牧師
獻堂日期：1966年 4月 17日
歷任傳教者：
第一任：鄭金凱傳道(1961年至 1962年)
第二任：張 開傳道(1962年至 1966年)
第三任：劉竹村傳道(1966年至 1968年)
第四任：宋大衛牧師(1968年至 1971年)
第五任：謝木强傳道(1971年)
第六任：潘玉松傳道(1974年至 1977年)
第七任：文約翰牧師(1977年至 1979年)
第八任：林金一牧師(1979年 7月至 1981年)
第九任：蔡新民傳道(1991年 8月至今)
第十任：周信勇牧師 (2001年 8月至 2003年 6月)
第十一任：吳謙從牧師(2005年10月至2006年 6月)
現任：許宏華牧師 (2006年 8月)
沿革
門諾會南屯教會，位於台中市南屯區向心路 2 號。由門諾會宣教士高甘霖及呂春長牧師，於1961年 4月共同開拓。1963年成立教會，1965年購得南屯區向心路現址，1965年 10月 17日擴建，1966年 4月獻堂。
南屯教會所在的位置，清朝時期稱為「犁頭店」，是彰化縣城到台中 (昔稱大墩) 必經之地。日本時代經烏日開闢公路、鐵路至台中後，逐漸衰落。天主教會、長老教會均曾派人至此傳教， 光復後，亦有其他教派曾前來傳教，均無功而返。
1961年門諾會來到這裡，原租三角街黃文樟先生店舖設立為佈道所，並聘請呂春長牧師為開拓事工佈道，當時尚有許遵道牧師、趙聰生、林汝聰及盧昭吉等人的協助，廖枰三先生提供自用吉普車連拖車，免費載運參聽之人，每次都有卅、四十人從文山里、春社里前來，每次的佈道會，皆使得這小小的佈道所座無虛席，這是南屯教會最早的會眾。
同年，教會聘請尚在就讀中台神學院的鄭金凱弟兄，協助呂牧師在南屯的開拓事工，於 1963年 9月 22日由宋大衛牧師主持第一次的洗禮， 共有廖枰三等 19 位受洗，並成立委員會共同管理，參與教會事工。首任委員有廖枰三、陳接旺以及張伯超。
在教會位置變化方面，南屯教會於 1963年由黃文樟先生的店舖遷移至南屯派出所西邊林輝南先生新建 2樓，1966年建堂之後即遷至現址，土地共計 125坪，經費大部分來自美國差會補助。
因著教會擴展的需要，成立建堂委員會，並於1965年 10月 17日在本會現址，舉行新的教堂奠基典禮，由當時聯會主席許遵道牧師主持，全部工程於 1966年3月 19日完竣， 於同年4月 17日舉行獻堂禮拜。
南屯教會於 1964年時，因私立嶺東工專就在教會附近的春日里開設，加上地理位置接近建功里軍眷區，人口有激增現象，曾擬在該地設置佈道所，該佈道所一切費用均由南屯教會會友奉獻，但未有後續。
南屯教會所開拓的地點，曾是天主教、長老教會開拓失利之地，南屯教會也成為其他教派短暫聚集之地，1983年 9月，長老教會再度於南屯開拓並創立教會，開始對原屬於長老會的會友進行「歸回長老會」工作，影響南屯教會教勢。南屯教會曾因此希望聯會與長老會進行協議，不要爭取門諾會會友，而是共同向未信者傳福音。
南屯教會成立時間雖早但發展並不順利，牧師更動頻繁，有些時期教會甚至沒有牧者。1972年 3月至 1974年 4月、1977年 4月至 1979年 7月、1981年 6月至 1991年 7月，這幾段時期沒有駐堂牧師，直至 2000年 10 ，透過聯會才再度有駐堂牧師。
2005年至 2006年教會兩任牧者任職期間，再次經歷分裂，南屯教會逐漸荒蕪，2006年 8月由現任許宏華牧師接任重新開展教會事工。至今，因著 神極大的憐憫，祂幫助南屯教會日漸穩固。
教會重要聖工
2014 年度主題：『作耶穌門徒 建造健康教會』
我們的計劃建立在聖經基礎之上，以 2014 年的門諾會年度主題：「作耶穌門徒，建造健康教會」，規劃事工幫助南屯教會的弟兄姐妹能將真理落實在生活中，希望藉由本年度事工能幫助每一位會友能來活出“遵行主真理”的生活來榮耀主的聖名，真正作耶穌門徒 成為健康教會。
●健康教會的特質：
一根基：以耶穌基督為唯一根基的教會。
二特質：無玷污 (聖潔無罪)、無皺紋(不老化，有活力)
鐵三角：聖經、聖靈、十字架的平衡。
四恩賜：使徒、先知、傳福音的、牧師和教師。
五功能：敬拜、教導、宣教、關懷 (團契)、服務 (服事) 均衡發展
●教會重要聖工以教會五大功能規劃事工：
一、敬拜事工：我們以心靈誠實的敬拜中頌揚神的臨在，使教會更健康。
1.主日崇拜臺語堂、國語堂：規劃作主門徒、建造健康教會為證道主題。
2.聖歌隊練唱、獻詩讚美上帝 ( 聖餐、洗禮、復活節、聖誕節 )。
3.敬拜讚美領唱事奉技巧培訓
4.每週三禱告會；並培訓信徒帶領禱告會。
二、宣教事工：我們願意活出真理使教會健康， 並將福音傳揚出去。
1.兒童夏令營 ( 七月 )。
2.野外禮拜 ( 九月 )。
3.聖誕節社區音樂佈道會 ( 十二月 )。
4.聖誕節中國醫學院報佳音 ( 十二月 )。
5.開拓教會 ( 台中北屯教會、大里救恩堂 )。
三、教導事工：我們願意學習真理使教會健康， 透過門徒訓練來教育神的百姓
1.聖經單卷書卷查經 ( 每週五晚上 )
2.聖經縱覽讀經填充題填寫活動。
3.聖經年度讀經計劃。
4.門徒訓練「耶穌的心」生命造就課程。
5.真理班「基督裡的新生命」真理造就課程。
四、團契事工：我們願意活出真理，使教會健康，與神家庭的成員組成團契
1.佩璇小組「讚美的大能」
2.瑞蓮小組 「耶穌的心」
3.週六青少年團契
4.兒童主日學
五、關懷事工：我們願意活出真理透過服事來表達神的愛，來健造健康教會
1.週二、週五探訪。
2.代禱分組。
3.關懷事工分配 ( 專人簡訊傳送 ) 。
4.facebook 文字事工關懷
展望
從南屯教會歷史沿革得知，教會幾經分裂，教勢微弱，雖建堂歲月已久，卻極為荒涼，毫無信仰根基，但聖經告訴我們：壓傷的蘆葦，祂不折斷；將殘的燈火，祂不吹滅。（馬太福音十二章 20 節）神始終保守著祂自己所愛的教會。
因著神的憐憫，許牧師以開拓的方式，展開南屯教會的事奉，於社區傳揚福音、教導真理、靈命造就、培育主的門徒。感謝 神的幫助，目前南屯教會成為一個有根基的健康教會，對會友而言南屯教會是他們生活中不可或缺的教會，人人願意傳揚福音、渴慕真道、愛神愛人，願為主耶穌做美好的見證。
南屯教會於 2014 年開拓門諾會大里救恩堂，並與大雅教會共同開拓北屯教會，樂意遵行主耶穌的大使命：「所以你們要去，使萬民作我的門徒，奉父子聖靈的名，給他們施洗，凡我所吩咐你們的，都教訓他們遵守，我就常與你們同在， 直到世界的末了。」( 馬太福音廿八章19-20 節)，感謝上帝無限的恩典，讓我們能夠於門諾會在台宣教六十週年的同時，拓展兩間教會，期盼能與眾教會分享開拓的喜悅，並將榮耀歸給上帝！
南屯教會 1966年 4月獻堂以來，教堂建築物已屆齡五十，老舊的建築空間規劃、建築安全性、合法性等都不敷使用。再者，教會週圍現代化的環境，以及捷運系統完工日期即將來臨，南屯地區面臨都會性的變遷，人口結構改變等各方面的因素，為因應時代性的福音需求，促使我們必須於向心路原地重建，成為「門諾會南屯教會向心宣教大樓」，請眾教會為我們代禱，並順利募得重建經費兩千萬元，願 神成就重建事工。使我們能服事更多的人群，讓南屯教會成為這地的祝福，見證主的榮耀。
建堂
南屯教會於2015年09月21日拆除舊堂，2016年10月24日開始新堂建置，於2019年08月10日獻堂。
